প্রাকৃতিক অথবা মানবসৃষ্ট কারণে মাটির স্বাভাবিক কার্যকারিতা যখন নষ্ট হয় তখন তাকে মাটিদূষণ বলে। মাটিদূষণ বিভিন্ন কারণে হতে পারে। যেমন- পশুপাখির খামারের মলমূত্র, কীটনাশক ও রাসায়নিক সার, মৃতজীবের ধ্বংসাবশেষ, তাপবিদ্যুৎ ও পারমাণবিক শক্তি কেন্দ্রের প্রভাব, ভূগর্ভস্থ পানির ঘাটতি প্রভৃতি উপাদানগুলো দ্বারা মাটি দূষিত হয়। এসব উপাদানগুলো মাটির সাথে মিশে মাটির স্বাভাবিক কার্যকারিতা নষ্ট করে দেয় বলে মাটিদূষণ ঘটে।